尿道結石的來源大致分兩類一種是「上游掉下來的石頭」，也就是腎臟或輸尿管的結石往下移動，最後卡在尿道；另一種是原地生成或在尿道停留變大，像是有尿道狹窄、曾做過尿道手術、長期留置導尿管、或因神經性膀胱導致排尿不完全的人，尿液停滯、感染反覆，就比較容易讓小結晶在下尿路聚集、逐漸形成結石。