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來源:哈拉閒聊   發佈於 2016-01-27 06:04

興大建構癌症生物資訊資料庫

記者蕭宇廷/臺中報導2016-01027
正常細胞與癌細胞會有基因表現量的差異,基因表達可以運用在癌症診斷與個人化醫療。核醣核酸定序(RNA-Seq)是近年發展的革命性次世代定序(NGS)技術。中興大學基因體暨生物資訊學研究所副教授劉俊吉研究團隊運用次世代定序大數據,建構了前所未有的癌症生物資訊資料庫,並正式於國際權威的期刊 Nucleic Acids Research上發表。
興大昨日指出,研究團隊是與美國南加州大學合作,經歷2年努力,建立了第一個大規模的癌症生物資訊庫:Cancer RNA-Seq Nexus (CRN http://syslab4.nchu.edu.tw/CRN)。這個大數據資料庫提供前所未有功能,包括大規模的癌症RNA數據,涵蓋30種以上的癌症與11,030 RNA定序樣本;包含編碼及長非編碼RNA (long non-coding RNA,lncRNAs) 表現量以及共表現網路;視覺化呈現表現量、差異表現基因以及基因調控網路。
該資料庫並可提供生物醫學研究者重要資源,藉此探討差異表現isoform以進行研究與預測,使了解癌症調控機制或治療模式,利於對癌症研究與個人化藥物治療產生新的假說,更有助於未來癌症醫學與臨床研究。

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