針對鑽石公主號台灣旅客返家安排，駐日代表謝長廷15日在臉書發文稱，乘客19日後才離開且檢查為陰性，「回自己國家也沒有再隔離的道理」。對此網友質疑不應冒險讓乘客變成防疫破口，外交部亦稱謝所言不符合疫情指揮中心決策並表示歉意。
謝長廷透露正與日方就包機載人一事交涉。謝說，依檢疫相關規定，旅客若19日前離開，回國仍需隔離，過了19日檢查還是陰性，「那麼他們在日本就可以自由行動，搭公共運輸工具，回自己國家也沒有再隔離的道理」。
謝的發言引發相當爭議，外交部16日表示，謝長廷在臉書上發表有關處理鑽石公主號乘客的意見或問卷，與中央流行疫情指揮中心決策不一致，外交部對造成的混淆與困擾表示歉意。謝長廷則緊急刪文，16日發布新文章表示，若疫情中心決定需要隔離，那就是決策，「只要事先講清楚就好」，再來就是執行。
鑽石公主號曾停靠基隆港，基隆市長林右昌指出，該船1月31日上午6時抵達基隆港，且遊客開始下船，提醒時已來不及，市府在香港發布旅客確診案例後，便立刻展開補救措施，日前居家隔離剛結束，無論全國或基隆都沒有相關案例發生，是值得慶幸的事。
林右昌說，若鑽石公主號停在基隆港時就發生確診案例，會產生很大的醫療壓力，「還是會心有餘悸」，但發現狀況後的因應處置，無論中央或地方都盡了最大努力；他也提到，基隆廟口生意雖因此受到衝擊，但其實最大壓力不在台灣，而是大陸的新冠肺炎疫情是否能減緩下來，希望疫情早日減緩，接著就可展開後續的振興工作。